松材线虫果胶酶基因Bxpel1的克隆及其生物信息学分析

编号 zgly0001650084

文献类型 期刊论文

文献题名 松材线虫果胶酶基因Bxpel1的克隆及其生物信息学分析

作者 邱秀文  周桂香  王慧娟  杨丽丽 

作者单位 九江学院鄱阳湖生态经济研究中心  九江学院九江市流域管理与生态保护重点实验室  九江学院化学与环境工程学院 

母体文献 浙江林业科技 

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 S763.18 

关键词 松材线虫  Bxpel1基因  克隆  生物信息学 

文摘内容 以松材线虫Bursaphelenchus xylophilus转录本为模板,通过RT-PCR技术克隆果胶酶Bxpel1基因。结果表明,松材线虫果胶酶Bxpel1基因序列全长为795bp,GC含量为50.44%,编码252个氨基酸。通过Blast比对克隆的Bxpel1基因与已知序列(Gen-Bank ID:AB232908.1)的同源性达到98%。系统进化分析表明,Bxpel1基因编码产物的氨基酸序列与拟松材线虫Bursaphelenchus mucronatus,燕麦真滑刃线虫Aphelenchus avenae的Bxpel1蛋白序列具有高度同源性。Bxpel1基因编码的产物的0～25序列有可能是跨膜结构域,而其他序列均位于膜外,其二级结构主要是以无规则卷曲和β-折叠为主,信号肽的剪切位点位于第17至第18位氨基酸之间,主要在细胞外发挥生物学作用。Bxpel1基因的克隆及其生物信息学分析对进一步研究Bxpel1基因在松材线虫致病过程中的功能具有重要意义。