油桐烯脂酰CoA还原酶的克隆与表达模式分析

编号 zgly0001463070

文献类型 期刊论文

文献题名 油桐烯脂酰CoA还原酶的克隆与表达模式分析

作者 刘美兰  谭晓风  龙洪旭 

作者单位 中南林业科技大学经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室 

母体文献 中南林业科技大学学报 

年卷期 2014年11期

年份 2014 

分类号 S794.3 

关键词 生物信息学  油桐  超长链脂肪酸  烯脂酰CoA还原酶  克隆技术  表达模式 

文摘内容 以葡萄桐近成熟种子为材料,根据油桐转录组数据库中已知部分烯脂酰CoA还原酶(enoyl-CoA reductase,ECR)序列,利用RACE克隆技术,克隆得油桐烯脂酰CoA还原酶的全长c DNA序列,命名为VfECR,并对该基因的核苷酸序列及其相应氨基酸序列的理化性质、疏水性/亲水性、跨膜结构域、蛋白质的二、三级结构、亲缘关系进行分析。结果表明:该基因全长1 154 bp,含有一个933 bp的开放阅读框,编码310个氨基酸,属于不稳定的亲水性蛋白,含有6个明显的跨膜结构域,且与陆地棉ECR蛋白的同源性最高,亲缘关系最为接近。同时利用RT-qPCR对VfECR基因的组织特异性和种子发育过程中的表达模式进行了分析,发现油桐Vf ECR基因主要在种仁中表达,在根、茎、叶等组织中表达量较少;在种子发育过程中,近成熟(8月、9月)到成熟种子(10月)中的表达量要明显高于未成熟种子(6月、7月)。