梁山慈竹BABY BOOM基因的克隆与表达分析

编号 zgly0001686708

文献类型 期刊论文

文献题名 梁山慈竹BABY BOOM基因的克隆与表达分析

作者 王丽丽  唐一  黄艳  曹颖  胡尚连 

作者单位 西南科技大学植物细胞工程实验室  四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心 

母体文献 竹子学报 

年卷期 2019年02期

年份 2019 

分类号 S795  Q943.2 

关键词 梁山慈竹  BBM基因  克隆  生物信息学  表达模式 

文摘内容 以梁山慈竹Dendrocalamus farinosus转录组数据库为基础,采用同源克隆技术从梁山慈竹笋中克隆到1个BABY BOOM(BBM)基因,命名为Df BBM,其开放阅读框长度为1101 bp,推测编码366个氨基酸残基。蛋白功能域预测分析表明,Df BBM基因含有AP2结构域,证明该基因确实属于AP2/ERF转录因子家族基因之一;进化树分析发现,Df BBM基因与玉米的BBM2以及山羊草和旱麦草的BBM基因在一个分支上,序列高度相似;保守结构域分析发现,Df BBM和Zm BBM2,Ae BBM1,Et BBM之间含有8个保守基序,这可能有助于研究Df BBM和其他物种BBM基因的相似功能。Df BBM的三级结构预测和乙烯反应性转录因子ERF096模型高度相似。组织表达分析表明,Df BBM基因在梁山慈竹展开叶和笋尖表达较高,Df BBM基因对ABA、IAA、NAA和Me JA激素处理均有响应,其中ABA、IAA和Me JA激素处理2 h后其表达量上升达到最高值,随后开始下降;而在NAA激素处理后其表达则明显下降。