鸭茅SSR-PCR反应体系优化及引物筛选

编号 zgly0000582525

文献类型 期刊论文

文献题名 鸭茅SSR-PCR反应体系优化及引物筛选

作者 谢文刚  张新全  彭燕  马啸  曾兵 

作者单位 四川农业大学  西南大学 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2008,6(2)

页码 381-386

年份 2008 

分类号 S66 

关键词 鸭茅  SSR-PCR  体系优化  引物筛选 

文摘内容 应用L16(44)正交设计对影响鸭茅SSR-PCR的主要参数进行优化,建立适于鸭茅的SSR反应体系和扩增程序。在15μL体系中各反应的最适合含量为：50ng模板DNA,240μmol/LdNTP,0.4μmol/LSSR引物,1.0UTaqDNA聚合酶,1.5μL10×PCRBuffer,2.5mmol/LMgCl2。PCR适宜扩增程序为：94℃预变性4min,94℃变性30s,52℃复性30s,72℃延伸1min,共35个循环,72℃延伸10min,4℃保存。并对引物最适合退火温度进行优化,最终确定引物退火温度为48～52℃。同时选用100对鸭茅引物对4份材料进行扩增,筛选出条带清晰,多态性好的引物30对。用于鸭茅SSR标记的进一步研究。