观赏海棠SSR-PCR体系优化及引物筛选应用

编号 zgly0001632078

文献类型 期刊论文

文献题名 观赏海棠SSR-PCR体系优化及引物筛选应用

作者 黄彬  倪州献  周婷  张往祥  徐立安 

作者单位 南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院 

母体文献 南京林业大学学报(自然科学版 

年卷期 2018年03期

年份 2018 

分类号 S685.99 

关键词 观赏海棠  SSR-PCR  体系优化  引物筛选 

文摘内容 【目的】为探究适用于观赏海棠SSR反应分子标记研究的最佳PCR反应条件,采用正交设计法对观赏海棠SSR-PCR体系进行优化,并利用优化体系筛选适于观赏海棠的多态性SSR引物。【方法】以6个二倍体观赏海棠DNA模板为材料,采用L16(45)正交试验对DNA模板浓度、Taq酶浓度、引物浓度、Mg2+浓度和d NTP浓度进行优化实验,确立了观赏海棠SSR-PCR最佳反应体系。【结果】得出15μL优化体系各成分为:DNA模板5 mg/L、Taq酶1.25 U、引物0.3μmol/L、Mg2+2 mmol/L、d NTP 0.25 mmol/L、1×Buffer1.5μL。利用优化体系在73对苹果属SSR引物中筛选出15对条带清晰、多态性丰富、重复性好的SSR引物并确定各引物的退火温度,其多态信息含量均大于0.25。【结论】正交试验结果达到优化目的,利用优化体系筛选的15对多态性引物可直接应用于观赏海棠SSR分子标记实验中,为观赏海棠品种鉴定、分类以及遗传育种等研究提供了有效工具。