苦楝SSR-PCR反应体系优化及引物筛选

编号 zgly0001501696

文献类型 期刊论文

文献题名 苦楝SSR-PCR反应体系优化及引物筛选

作者 王芳  廖柏勇  李培  刘明骞  李俊成  吴琳瑛  林玮  陈晓阳 

作者单位 华南农业大学林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室  北京林业大学生物科学与技术学院 

母体文献 林业科学研究 

年卷期 2016年02期

年份 2016 

分类号 S792.33 

关键词 苦楝  SSR-PCR  体系优化  引物筛选 

文摘内容 [目的]借鉴以往楝属文献报道的SSR引物,筛选高度多态性、稳定性高、重复性好的苦楝SSR引物,为苦楝遗传图谱构建、QTL定位和分子标记辅助选择育种等研究领域应用奠定基础。[方法]本研究采用单因素法和正交试验设计进行SSR-PCR反应体系优化,并利用该体系以8个不同种源的苦楝基因组DNA为模板,从135对候选SSR引物中进行引物筛选。[结果]苦楝SSR-PCR最优反应体系为:1.0μL 50 ng·μL-1模板DNA,1.2μL 100μmol·L-1引物,1.0μL 10 mmol·L-1d NTPs,0.8μL 25 mmol·L-1Mg2+,0.15μL 5 U·μL-1Taq酶,1.5μL 10×Buffer,补dd H2O至15μL;最终筛选出15对具有高度多态性、稳定性高、重复性好的SSR引物。[结论]本研究成功优化了苦楝SSR-PCR反应体系,并成功筛选出15对适用于苦楝的SSR引物。