药用菊花SSR-PCR反应体系优化及引物筛选

编号 zgly0001496161

文献类型 期刊论文

文献题名 药用菊花SSR-PCR反应体系优化及引物筛选

作者 何仁锋  冯尚国  陈喆  沈晓霞  沈宇峰  王志安  王慧中 

作者单位 杭州师范大学生命与环境科学学院  浙江省药用植物种质改良和质量监控重点实验室  浙江省中药研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2015年02期

年份 2015 

分类号 S682.11 

关键词 药用植物  菊花  正交设计  SSR-PCR  体系优化  引物筛选 

文摘内容 为进一步开发利用药用菊花种质资源和开展分子标记辅助选择育种,本研究利用L25(56)正交设计对影响药用菊花SSR-PCR反应的模板DNA、Mg2+、d NTPs、Taq酶、引物等5个因素进行优化,并对SSR引物进行筛选。结果建立了药用菊花SSR-PCR最佳反应体系(20μL):模板DNA 60 ng,正、反向引物0.25μmol/L,d NTPs 0.3 mmol/L,Mg2+3.0 mmol/L,Taq酶1.5 U。运用优化后的反应体系,从136对引物中成功筛选出了扩增条带清晰、多态性丰富的SSR引物57对,大多数条带大小集中在100~500 bp,不同引物扩增的条带数为5~15条。优化的SSR-PCR反应体系在多个药用菊花品种遗传多样性研究中得到了验证,获得了稳定性、重复性良好和多态性丰富的扩增图谱。该体系的建立可为今后利用SSR标记对药用菊花种质鉴定、遗传多样性分析、系统发育研究、遗传图谱构建、基因定位和分子标记辅助育种等研究提供了依据。