云锦杜鹃ISSR扩增条件的优化

编号 zgly0000519153

文献类型 期刊论文

文献题名 云锦杜鹃ISSR扩增条件的优化

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 顾奇萍  金则新  李钧敏 

作者单位 西南大学三峡库区生态环境教育部重点实验室  台州学院生态研究所 

母体文献 广西植物 

年卷期 2007,27(4)

页码 560-563

年份 2007 

分类号 Q943 

关键词 云锦杜鹃  ISSR  优化  遗传多样性 

文摘内容 以云锦杜鹃基因组DNA为研究对象,对影响ISSR-PCR扩增效果的一些因素,包括镁离子浓度、dNTP浓度、模板DNA含量、TaqDNA聚合酶量、BSA浓度、引物用量以及退火温度等进行筛选和优化,建立了稳定、可重复的最佳反应体系：10μLPCR反应体积中,1×Taq酶配套缓冲液(10mmol/LTris.HClpH9.0,50mmol/LKCl,0.1%TritonX-100),1.5mmol/LMgCl2,0.15mmol/LdNTP,0.45UTaqDNA聚合酶,2mg/mLBSA,12pmol引物,16ng模板DNA。利用所建立的优化反应体系从100个ISSR引物中共筛选出12个稳定性好、重复性高的引物,对5个居群共100个云锦杜鹃个体的DNA进行扩增,检测到170个位点,其中多态位点150个,多态位点百分率88.24%,5个居群的多态位点百分率平均为48.23%。云锦杜鹃ISSR反应体系的建立为利用ISSR分子标记技术研究云锦杜鹃的遗传多样性奠定了良好的基础。