光皮树SNP高密度遗传图谱构建

编号 zgly0001747112

文献类型 期刊论文

文献题名 光皮树SNP高密度遗传图谱构建

作者 吉悦娜  夏栗  曾霞  张路红  陈韵竹  杨艳  李培旺  李党训  陈景震 

作者单位 湖南省林业科学院省部共建木本油料资源利用国家重点实验室  湖南财政经济学院  中南林业科技大学生命科学与技术学院 

母体文献 湖南林业科技 

年卷期 2023,50(2)

页码 74-82

年份 2023 

分类号 S749.9 

关键词 遗传图谱  光皮树  遗传多样性  单核苷酸多态性 

文摘内容 本研究采用F1代群体简化基因组测序(RAD-seq)技术,构建了光皮树亲本的遗传图谱。统计结果显示,SNP基因分型共57089个,校正后为57071个,基因型为hk×hk、nn×np和lm×ll。过滤与筛选后统计占比,hk×hk为28.59%,nn×np为14.52%,lm×ll为12.92%。通过对F1代进行连锁遗传图谱标记,9个连锁群综合遗传距离从93.26到241.02 cM不等,综合覆盖图距为1260.94 cM,平均每个连锁群1091个标记,标记数最大的连锁群是Lg1,标记数为1744个;标记数最小的连锁群是Lg9,只有579个。通过对SNP标记数、标记距离和覆盖图距3个参数指标进行相关性分析,SNP标记数与覆盖图距呈极显著正相关,相关系数0.907。本研究构建了光皮树高密度遗传图谱,为其农艺性状定位与基因挖掘奠定了良好的基础。