泡桐高密度分子遗传图谱的构建

编号 zgly0001676928

文献类型 期刊论文

文献题名 泡桐高密度分子遗传图谱的构建

作者 李文杨  王娟  赵振利  范国强 

作者单位 信阳农林学院林学院  河南农业大学泡桐研究所 

母体文献 中南林业科技大学学报 

年卷期 2019年09期

年份 2019 

分类号 S792.43 

关键词 泡桐  遗传图谱  限制性酶切位点相关DNA测序  单核苷酸多态性 

文摘内容 以毛泡桐Paulownia tomentosa为母本、白花泡桐Paulownia fortunei为父本进行正反交,以杂交获得的子一代(F1)构建泡桐连锁图谱的作图群体,选取限制性内切酶EcoRI对185个样品的基因组进行酶切,利用Illumina Hiseq2000测序平台进行RAD测序建库,以白花泡桐基因组为参考,采用SOAP2软件进行序列比对,利用筛选到的单核苷酸多态性SNP(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)位点对该群体进行基因型分析,使用Joinmap version 4.0软件构建泡桐连锁遗传图谱。结果表明:利用RAD测序技术共获得551 894个SNP标记,构建了含20个连锁群的泡桐遗传连锁图谱,该图谱的总图距为2 050.77 cM,标记间平均图距为0.58 cM,图谱预期长度为2 064.29 cM,图谱基因覆盖度为99.35%。本研究构建的泡桐连锁遗传图谱具有高精度和覆盖泡桐基因组完整(构建连锁群数目等于泡桐单倍体基因组染色体的数目)的优点,为泡桐分子育种学研究奠定了基础。