林麝肺炎克雷伯氏菌的分离鉴定及其kp05372基因的生物信息学分析

编号 zgly0001559198

文献类型 期刊论文

文献题名 林麝肺炎克雷伯氏菌的分离鉴定及其kp05372基因的生物信息学分析

作者 赵位  王吴优  程建国  田青  罗燕 

作者单位 四川农业大学动物医学院  四川养麝研究所 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2017年12期

年份 2017 

分类号 S852.61 

关键词 林麝  肺炎克雷伯氏菌  kp05372  生物信息学分析 

文摘内容 【目的】对1株疑似肺炎克雷伯氏菌进行分离鉴定及全基因测序分析,并对发现的新基因kp05372编码产物进行生物信息学分析。【方法】采用传统的细菌鉴定方法和分子生物学方法,分别对采自麝粪便的1株病原菌的生理生化特征及16SrRNA序列进行测定;以小鼠感染试验和半数致死量(LD50)测试该病原菌的致病性;用全基因组测序方法对病原菌基因组进行测序分析,并对发现的新基因编码产物进行生物信息学分析。【结果】经生理生化试验和16SrRNA序列分析发现,分离菌株为肺炎克雷伯氏菌,命名为GPKP,其对小鼠致死的LD50为6.3×107CFU/mL。该菌基因组大小为4 879 707bp,包含5 490个开放阅读框,共注释到22组COG功能。kp05372基因编码产物由302个氨基酸组成,无信号肽,是一种不稳定的、在细胞内发挥生理作用的亲水性蛋白。【结论】分离的细菌为肺炎克雷伯氏菌,kp05372基因编码产物属于典型的LysR家族转录因子(LTTR)。