全基因组预测樟疫霉的候选效应分子

编号 zgly0000959692

文献类型 期刊论文

文献题名 全基因组预测樟疫霉的候选效应分子

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 韩长志 

作者单位 西南林业大学林学院  云南省森林灾害预警与控制重点实验室 

母体文献 南京林业大学学报;自然科学版 

年卷期 2015(2)

页码 69-74

年份 2015 

关键词 樟疫霉  候选效应分子  全基因组  分泌蛋白 

文摘内容 为了更好地研究樟疫霉的致病机制及防治方法,笔者基于病原菌效应分子具有的典型特征,利用Signal P、Prot Comp、TMHMM、big-PI Fungal Predictor和Target P等生物信息学预测程序对樟疫霉中328 457条蛋白质序列进行候选效应分子找寻,发现该菌含有3 439个小分子分泌蛋白,同时,对上述蛋白进行冗余性、半胱氨酸数量以及信号肽长度等性质进行分析。结果表明:上述分泌蛋白中存在较多的冗余性蛋白,所占比例为50%以上,并以含有1~10个半胱氨酸、17~26个氨基酸信号肽的分泌蛋白居多。