基于转录组的漆树MYB转录因子的筛选及分析

编号 zgly0001726679

文献类型 期刊论文

文献题名 基于转录组的漆树MYB转录因子的筛选及分析

作者 谢冬冬  王武萍  何学高  黄晓华 

作者单位 西北农林科技大学林学院  中华全国供销合作总社西安生漆涂料研究所 

母体文献 西北林学院学报 

年卷期 2021,36(1)

页码 108-116

年份 2021 

分类号 S794.2 

关键词 漆树  MYB转录因子  基因家族  生物信息学  GO功能注释  基因表达 

文摘内容 MYB转录因子家族是植物最大的转录因子家族之一,在植物生长发育、形态建成、次生代谢等的调控中起着重要作用。本研究在漆树转录组测序的基础上,应用生物信息学方法,筛选到48个漆树MYB转录因子,依据MYB保守域的特点将其分为3类:1条R3-MYB序列,21条R2R3-MYB序列和26条R1-MYB序列。结果表明,蛋白序列分析显示,48条漆树MYB转录因子大部分属疏水性蛋白,且无规则卷曲和α螺旋在二级结构中占有较大比例。GO分析发现漆树R2R3-MYB蛋白共注释到生物学过程、细胞组分和分子功能3大类功能的27个亚类。系统进化分析将48个漆树MYB转录因子分为了8个亚组。表达谱数据分析表明,漆树MYB基因的表达具有组织特异性,11个在叶片中高水平表达,21个在茎中的表达量较高。研究结果为今后进一步解析漆树MYB转录因子的结构和生物学功能奠定基础,有助于进一步研究漆树MYB转录因子在次生代谢产物中的调控功能。