蝴蝶兰MYB家族基因鉴定及应对病毒的表达响应

编号 zgly0001652499

文献类型 期刊论文

文献题名 蝴蝶兰MYB家族基因鉴定及应对病毒的表达响应

作者 蒋卉  张晶  袁欣  符真珠  高杰  董晓宇  王慧娟  李艳敏  王利民  张和臣 

作者单位 河南省农业科学院园艺研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年21期

年份 2018 

分类号 S436.8 

关键词 MYB转录因子  蝴蝶兰  基因家族  病毒 

文摘内容 MYB转录因子是一类参与调控次生代谢和细胞形态、增强抗病性和应对生物和非生物胁迫反应的蛋白家族。本研究依据小兰屿蝴蝶兰(Phalaenopsis equestris)基因组和蝴蝶兰‘大辣椒’(Phalaenopsis‘Big Chili’)响应病毒胁迫转录组的测序结果,采用Pfam、HMMER、OrchidBase 3.0网站和Bioedit、MEGA 5.1、Jalview软件,对蝴蝶兰MYB家族基因进行了筛选和分类,分析了其基因类型、结构特点和系统进化关系,从小兰屿蝴蝶兰中筛选到152个MYB家族基因,其中R2/R3型6个、R2R3型138个、R1R2R3型3个。从大辣椒响应病毒胁迫转录组数据中共筛选得到55个MYB家族基因,其中有7个在响应不同时期差异表达明显,2个R2R3-MYB亚家族基因在感染病毒初期和携带病毒时期大幅上调,3个与小兰屿蝴蝶兰同源性较低。通过对小兰屿蝴蝶兰基因组和蝴蝶兰‘大辣椒’响应病毒胁迫时期MYB基因的筛选,为研究蝴蝶兰响应病毒关键MYB家族基因的分子功能提供了重要依据。