杨树MYB转录因子家族基因应答盐胁迫表达特性分析

编号 zgly0001568025

文献类型 期刊论文

文献题名 杨树MYB转录因子家族基因应答盐胁迫表达特性分析

作者 李晰妍  赵凯  张雪梅  周博如 

作者单位 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室 

母体文献 植物研究 

年卷期 2017年03期

年份 2017 

分类号 Q943.2  S792.11 

关键词 杨树  MYB转录因子  生物信息学  RT-qPCR 

文摘内容 MYB转录因子家族是植物中数量最多的转录因子家族之一,在植物次生代谢调节、信号转导和抗逆等生物过程起重要作用。根据MYB转录因子结构域组成差异可分4个亚家族:即1R-MYB(MYB-relaed)、R2R3-MYB、3R-MYB和4R-MYB。其中,R2R3-MYB亚家族数量最多,可进一步分为22个亚组;利用生物信息学分析杨树MYB转录因子蛋白序列的保守结构域、系统发生、基因组定位、氨基酸组成和理化性质等;参照拟南芥MYB转录因子功能,预测杨树MYB转录因子功能;基于84K杨转录组测序和RT-qPCR分析,从301个杨树MYB转录因子基因中筛选出69个应答盐胁迫基因(P≤0.05)。其中,上调表达基因32个,下调表达基因37个。该研究可为进一步研究杨树MYB家族基因功能提供参考依据。