杨树扩展蛋白基因家族的生物信息学分析

编号 zgly0000835095

文献类型 期刊论文

文献题名 杨树扩展蛋白基因家族的生物信息学分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 李昊阳  施杨  丁亚娜  徐吉臣 

作者单位 北京林业大学林木育种国家工程实验室 

母体文献 北京林业大学学报 

年卷期 2014(2)

页码 59-67

年份 2014 

关键词 杨树  扩展蛋白  细胞壁  基因家族  生物信息学 

文摘内容 扩展蛋白是植物细胞壁的重要组成部分,广泛存在于植物基因组中,具有疏松细胞壁组分、增加细胞壁柔韧性的作用,在植物的生长发育及抗性等多个方面起着重要的作用。全基因组序列分析显示,杨树中的扩展蛋白基因家族包含36个成员,分属于EXPA、EXPB、EXLB和EXLA 4个亚家族。系统生物信息学分析表明,杨树扩展蛋白基因具有保守的序列特征和稳定的蛋白结构,包括9种不同的内含子起源模式以及6个高频密码子。基因表达分析显示,该家族基因在杨树木材形成相关的组织/器官中表达丰度较高,对林木生殖发育也起着重要的作用。研究结果展示了杨树扩展蛋白基因家族的基本信息和特点,为深入研究杨树扩展蛋白基因的功能搭建平台。