基于红掌转录组序列的SSR标记分析与开发

编号 zgly0000927234

文献类型 期刊论文

文献题名 基于红掌转录组序列的SSR标记分析与开发

作者 郁永明  田丹青  潘晓韵  金亮  葛亚英 

作者单位 浙江省农科院花卉研究开发中心 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2015(6)

页码 1349-1354

年份 2015 

关键词 红掌  转录组  SSR  引物 

文摘内容 本研究从红掌转录组共32 391条unigenes中搜索得到3 944个SSR位点,出现频率为12.17%。EST-SSR类型以一、二、三核苷酸重复为主,占总SSR比例的96.29%,其中二核苷重复为主要基序类型,占总SSR的51.01%,AG/CT重复类型出现最多。设计合成的200对SSR引物中有22对引物扩增条带清晰、多态性好,在18个红掌品种中得到有效性验证。结果表明,基于红掌转录组序列的SSR标记开发是可行的,这些EST-SSR的开发可为红掌遗传多样性分析、分子育种等奠定重要基础。