桃(Prunus persica [L.] Batsch)转录组SSR信息分析及其分子标记开发

编号 zgly0001529004

文献类型 期刊论文

文献题名 桃(Prunus persica [L.] Batsch)转录组SSR信息分析及其分子标记开发

作者 何平  李林光  王海波  李慧峰  常源升 

作者单位 山东省果树研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2016年11期

年份 2016 

分类号 S662.1  Q943.2 

关键词 桃  转录组  SSR  引物  多态性 

文摘内容 利用MISA软件筛选桃(Prunus persica[L.]Batsch)转录组数据,获得的109 248条Unigene,检测出24 102个SSR位点,分布于22 689条Unigene中,出现频率为20.76%。SSRs位点中主导类型是以AG/CT(占总SSRs的18.70%)为主的二核苷酸重复,占总SSRs的33%;其次是三核苷酸重复,出现频率为27%;四核苷酸重复,占总SSRs的25%。利用Primer 5共设计出9 657对SSR引物。随机选择50对引物进行PCR扩增,其中20对扩增出清晰可重复的条带,并且在同属材料(苹果试材)中也能获得理想结果,引物多态性检测发现,在15份桃试材中,10对引物具有多态性,利用UPGMA作图,可将15个桃材料很好区分。结果表明,桃转录组测序产生的Unigene是开发SSR标记的有效信息,为SSR标记在桃的遗传分析上提供可靠的标记选择。