利用EST-SSR通用性和EST数据库筛选三叶草EST-SSR分子标记

编号 zgly0001516623

文献类型 期刊论文

文献题名 利用EST-SSR通用性和EST数据库筛选三叶草EST-SSR分子标记

作者 高雪  王秀华  石香雪  李家丽  赵岩 

作者单位 土肥资源高效利用国家工程实验室/山东农业大学资源与环境学院  作物生物学国家重点实验室/山东农业大学农学院 

母体文献 中国草地学报 

年卷期 2016年06期

年份 2016 

分类号 S541.2 

关键词 三叶草  EST-SSR  通用性  标记开发  遗传多样性 

文摘内容 为加速分子标记在三叶草中的应用,利用三叶草EST数据库(GenBank/dbEST)和EST-SSR的通用性,开展了三叶草EST-SSR分子标记筛选及利用研究。从五种作物和三叶草的EST数据中共筛选出445对EST-SSR引物,挑选107对引物用于5个三叶草品种的遗传多样性分析,其中表现多态性的引物为103对(96.3%),检测到的等位变异为293个,每对引物的等位变异数目为1~6(平均2.8),PIC值最高、最低、平均分别为0.79、0.28和0.55。聚类分析表明,在相似系数0.618水平可分为三大类,类Ⅰ由海发、瑞文德和碧盛组成,类Ⅱ为杂三叶,类Ⅲ为红三叶。