偃麦草EST-SSR标记开发及应用

编号 zgly0001617478

文献类型 期刊论文

文献题名 偃麦草EST-SSR标记开发及应用

作者 王瑞晶  李培英  张延辉 

作者单位 新疆农业大学草业与环境科学学院新疆草地资源与生态自治区重点实验室 

母体文献 草业科学 

年卷期 2016年08期

年份 2016 

分类号 S54 

关键词 偃麦草  EST-SSR  标记开发  遗传多样性 

文摘内容 利用NCBI数据库中偃麦草(Elytrigia repens)EST序列开发偃麦草EST-SSR引物,并对47份偃麦草资源进行遗传多样性分析,验证所开发EST-SSR引物在偃麦草上的可应用性。结果显示,在27 891条偃麦草EST序列中可以搜索到SSR位点1 068个;其中六核苷酸重复序列最多,占总SSR的53.83%;二、三、四、五、六核苷酸优势重复基元及出现频率分别为AC/TG(2.72%)、CGC/GCG(1.87%)、CGAC/GCTG(5.24%)、CCGCC/GGCGG(0.37%)、CAGCTC/GTCGAG(3.37%)。开发的105对偃麦草EST-SSR引物中有64对引物(60.95%)可以有效扩增;随机选取18对多态性引物对47份偃麦草进行遗传多样性分析,其多态性百分率为78.64%,多态性指数(PIC)为0.22~0.83。以上结果表明,开发的偃麦草EST-SSR标记是有效的,有较高的应用价值,为偃麦草遗传多样性、重要性状关联分析研究奠定了基础。