尖镰孢菌EST-SSR遗传多样性分析及通用性评价

编号 zgly0001494716

文献类型 期刊论文

文献题名 尖镰孢菌EST-SSR遗传多样性分析及通用性评价

作者 李新凤  王建明  张作刚  郝晓娟  张祖维  田宏先 

作者单位 山西农业大学农学院  山西农业大学动物科技学院  山西省农业科学院高寒区作物研究所 

母体文献 植物保护学报 

年卷期 2015年05期

年份 2015 

分类号 S432.4 

关键词 尖镰孢菌  EST-SSR  遗传多样性  通用性 

文摘内容 为了解38株尖镰孢菌的遗传多样性并开发可在近缘镰孢菌种中通用的尖镰孢菌EST-SSR标记,利用设计和筛选的18对多态性EST-SSR引物对38株尖镰孢菌和5种近缘镰孢菌进行SSRPCR扩增,经6%非变性聚丙烯酰胺凝胶分离扩增产物,并用NTSYS软件分析供试尖镰孢菌的PCR扩增结果。结果表明,18对EST-SSR标记引物在38株尖镰孢菌中检测到75条多态性条带,多态性比率达92.6%,平均每对引物可扩增4.2条;各菌株间的遗传相似系数介于0.565~0.946之间,平均为0.721;来源于同科寄主植物群体的菌株间的平均遗传相似系数以葫芦科最大,锦葵科最小,依次为葫芦科>兰科>豆科>亚麻科>茄科>锦葵科。在相似系数为0.756时,供试38株菌有35株按照不同科寄主植物聚为不同的类群,说明尖镰孢菌SSR类群的划分与其寄主来源具有一定的相关性。18对EST-SSR引物在近缘镰孢菌种中均能有效扩增的引物数及通用性比率为10对和55.6%,均显示多态性的引物有2对,占供试引物总数的11.1%。表明尖镰孢菌ESTSSR区域遗传多样性丰富,基于尖镰孢菌EST序列开发镰孢菌通用SSR标记是可行的。