萱草microRNAs生物信息学及与冷冻相关microRNAs的分析

编号 zgly0000901853

文献类型 期刊论文

文献题名 萱草microRNAs生物信息学及与冷冻相关microRNAs的分析

作者 安凤霞  卢宝伟  梁鸣  唐焕伟  李富恒 

作者单位 东北农业大学生命科学学院  黑龙江省科学院自然与生态研究所  湿地与生态保育国家地方联合工程实验室  黑龙江省特色动植物利用工程技术研究中心  黑龙江生态工程职业学院 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2014(4)

页码 483-487

年份 2014 

关键词 萱草  miRNA  生物信息学  低温  深度测序 

文摘内容 microRNA是一类长度为16~29 nt的非蛋白质编码的内源小分子RNA(sRNA),在植物生长发育以及逆境胁迫响应等过程中发挥着重要作用。本文利用基于HiSeq原理的sRNA深度测序技术,结合生物信息学方法对萱草根系中已知miRNA的类型、丰度以及部分与冷冻胁迫相关的已知miRNA的功能进行了分析。结果表明,在10℃常温和-25℃低温条件下萱草根系中分别有14843184和16072575条序列信息,代表14064385和15309725种sRNA片段,且sRNA均呈现正态分布特征;在非编码RNA中转运RNA(tRNA)、核糖体RNA(rRNA)所占比例较大。