梨花芽休眠相关miRNA的鉴定和差异表达分析

编号 zgly0001651744

文献类型 期刊论文

文献题名 梨花芽休眠相关miRNA的鉴定和差异表达分析

作者 马鑫瑞  李亮  刘瑾航  杨梦洁  陈洁  梁沁  吴少华  李永裕 

作者单位 福建农林大学园艺学院福建农林大学园艺学院天然产物研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2018年11期

年份 2018 

分类号 S661.2 

关键词 梨  休眠芽  miRNA  高通量测序  生物信息学  qPCR 

文摘内容 为了探究梨花芽休眠进程中miRNA的表达模式和靶基因,利用Solexa测序技术、生物信息学分析和实时荧光定量PCR(qPCR)技术,对内休眠、内休眠解除和生态休眠解除3个时期梨花芽的miRNA进行高通量测序、筛选和鉴定。结果表明,内休眠、内休眠解除和生态休眠解除时期3个样本文库中分别有12 276 226、10 135 952、11 453 981条Unique序列。miRNA主要分布在21～24 nt之间,其中长度为24 nt的数量最多。共检测到151个已知的miRNA,属于39个不同的家族,并利用生物信息学软件预测到了209个新的miRNAs。比较分析从内休眠进入到生态休眠解除的整个休眠转换时期差异表达的miRNA,筛选出8个miRNA(ahy-miR156b-5p、cpa-miR319、aly-miR172c-3p、aau-miR396、mdm-miR858、aly-miR171b-3p、bdi-miR160f和hbr-miR166a),其靶基因主要参与转录调控、信号传导等过程。利用qPCR验证了8个miRNA及其8个靶基因的表达。