降解组测序技术在植物miRNA研究中的应用

编号 zgly0001461343

文献类型 期刊论文

文献题名 降解组测序技术在植物miRNA研究中的应用

作者 董淼  黄越  陈文铎  徐涛  郎秋蕾 

作者单位 浙江理工大学生命科学学院  杭州联川生物技术有限公司 

母体文献 植物学报 

年卷期 2013年03期

年份 2013 

分类号 Q943.2 

关键词 降解组测序  高通量测序  miRNA  靶基因 

文摘内容 目前,利用芯片技术和miRNA测序可快速、准确地检测到物种中所含有的miRNA。随着越来越多的miRNA被发现,miRNA靶基因的确定已成为研究miRNA生物学功能的关键。传统的miRNA靶基因的寻找主要依赖生物信息学预测、AGO蛋白免疫共沉淀和荧光素酶法等。随着高通量测序技术的持续革新,出现了一种新的miRNA靶基因的检测方法,即降解组测序(degradome sequencing)法,该方法拥有高通量测序技术、生物信息学分析和RACE验证三者的优势,并已成功应用于拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)和小立碗藓(Physcomitrella patens)等模式植物miRNA靶基因的检测。基于已发表的相关文献和联川生物降解组测序平台,该文对降解组测序技术应用于植物miRNA靶基因的研究进展及其实验原理进行了综述,同时对运用该技术可进行的更深入研究进行了讨论。