EST-SNP开发软件特性分析及比较

编号 zgly0000758836

文献类型 期刊论文

文献题名 EST-SNP开发软件特性分析及比较

作者 李猛  郭大龙  刘崇怀  张国海 

作者单位 河南科技人学林学院  中国农业科学院郑州果树研究所 

母体文献 生命的化学 

年卷期 2011,31(6)

页码 906-911

年份 2011 

分类号 Q81 

关键词 SNP  软件分析  测序峰图  EST序列 

文摘内容 利用生物信息学软件, 对表达序列标签(EST)序列进行单核苷酸多态性(SNP)开发目前已较为普遍, 其方法简单实用, 且软件数量较多, 可分为需要测序峰图的SNP开发软件和不需要测序峰图的SNP开发软件。对何测序峰图的序列进行SNP开发, 操作步骤较少且结果较为精确; 对无测序峰图的序列进行SNP开发可大批量操作且成本较低。本文针对这两类软件进行分析比较, 闸述EST-SNP开发流程, 重点分析以公共数据库中EST序列为基础的SNP开发过程, 并对其各种使用参数加以说明, 旨在为EST-SNP开发提供参考, 提高效率。