竹亚科叶绿体基因组的密码子使用偏性分析

编号 zgly0001653155

文献类型 期刊论文

文献题名 竹亚科叶绿体基因组的密码子使用偏性分析

作者 吴妙丽  陈世品  陈辉 

作者单位 福州外语外贸学院  福建农林大学林学院 

母体文献 森林与环境学报 

年卷期 2019年01期

年份 2019 

分类号 Q943.2 

关键词 竹亚科  叶绿体基因组  密码子使用偏性 

文摘内容 以3种竹亚科植物的叶绿体基因组编码基因为研究对象,分析基因的密码子偏性形成的主要因素。结果显示:3种竹子具有相似的密码子使用模式,均偏爱以A或T结尾的密码子。奇偶偏好性分析进一步证实密码子第3位T的出现频率高于A。通过中性分析发现,GC12与GC3并无显著相关性。奇偶偏好分析表明,4种碱基不成比例分布在密码子第3位上(CT>AG),说明选择压力可能起到重要作用。基于同义密码子的相对使用度(RSCU)的对应分析中,第1主向量轴仅解释了约10%的变异; 3种竹子的轴2一致地与CAI呈显著负相关(P<0.05);轴4与ENC、GC3呈极显著相关(P<0.05)。综合以上结果,竹亚科叶绿体基因密码子的使用偏性是由自然选择和碱基组成共同作用形成,选择压力起主要作用。