早酥梨及其红色芽变Ty1-copia反转录转座子逆转录酶的克隆与分析

编号 zgly0000890308

文献类型 期刊论文

文献题名 早酥梨及其红色芽变Ty1-copia反转录转座子逆转录酶的克隆与分析

作者 周鹏  仇宗浩  翟锐  梁东  徐凌飞 

作者单位 西北农林科技大学园艺学院  农业部西北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室 

母体文献 西北农林科技大学学报;自然科学版 

年卷期 2014(5)

页码 162-170+182

年份 2014 

关键词 梨  红色芽变  逆转录酶  进化分析 

文摘内容 【目的】从早酥梨及其红色芽变基因组中克隆Ty1-copia反转录转座子逆转录酶序列,分析其特点和差异。【方法】根据Ty1-copia反转录转座子逆转录酶保守区域设计简并引物,建立并优化PCR扩增体系,回收、克隆、测序得到的目的基因序列。【结果】成功从早酥梨基因组和红色芽变材料中分别获得29,30条逆转录酶序列,序列大小均为260bp左右。生物信息学分析表明,与早酥梨相比,红色芽变的逆转录酶序列多发生终止子突变、缺失突变、替换突变。聚类分析可将所得序列分为7个家族,基于逆转录酶序列进行的不同物种进化树分析显示,第7家族序列与苹果和李具有很高的同源性,可能是反转录转座子横向传递的结果。