望春玉兰WRKY基因家族生物信息学分析

编号 zgly0001740613

文献类型 期刊论文

文献题名 望春玉兰WRKY基因家族生物信息学分析

作者 戴晓港  刘景胜  李淑娴 

作者单位 南京林业大学林学院/南方杨树工程技术研究中心/江苏省杨树种质创新与品种改良重点实验室 

母体文献 江苏林业科技 

年卷期 2021,48(6)

页码 1-9

年份 2021 

分类号 Q756  S792.9.9 

关键词 望春玉兰  WRKY转录因子  进化分析  基因表达模式 

文摘内容 WRKY超级转录因子基因家族,参与植物生长、发育、非生物胁迫以及次生代谢产物的调节。该文鉴定了药用植物望春玉兰全基因组WRKY基因,并采用生物信息学方法,分析了该基因家族成员的蛋白理化性质、亚细胞定位、系统进化、保守结构域、顺式作用元件,以及在不同组织中的表达模式。在望春玉兰全基因组中共鉴定56个WRKY基因;根据进化分析的结果,将这些基因分为3个组(GroupⅠ—Ⅲ),又将GroupⅡ进一步分为5个亚组(Ⅱa—Ⅱe)。该家族基因蛋白分子量在12215.15—191326.88 Da之间,理论等电点在4.9—10.06之间。亚细胞定位结果显示,55个基因家族成员定位在细胞核,其中1个基因同时定位在细胞外间隙,还有1个基因定位在细胞质。顺式作用元件分析表明,望春玉兰WRKY基因除了广泛参与到调节非生物胁迫中,还参与次生代谢产物的合成调控。该文同时分析了WRKY基因在根、叶片和花中的表达模式,并鉴定了组织特异表达基因。通过对望春玉兰WRKY基因家族的生物信息学分析,为深入研究WRKY基因家族的功能提供了基础。