丹参肉桂酰辅酶A还原酶基因克隆与生物信息学分析

编号 zgly0000763746

文献类型 期刊论文

文献题名 丹参肉桂酰辅酶A还原酶基因克隆与生物信息学分析

学科分类 220.45;经济林学

作者 陈尘  王政军  曹鑫林  王喆之 

作者单位 教育部药用资源与天然药物化学重点实验室  西安铁一中 

母体文献 西北植物学报 

年卷期 2011,31(10)

页码 1963-1968

年份 2011 

分类号 Q785 

关键词 丹参  SmCCR-2  生物信息学分析  表达模式 

文摘内容 分析丹参转录组数据库,获得一条新的肉桂酰辅酶A还原酶(cinnamoyl-CoA reductase,CCR)基因,命名为SmCCR-2(GenBank注册号为JF784010)。该基因包含一个长为966 bp的完整开放读码框,编码321个氨基酸残基。生物信息学分析显示,SmCCR-2编码的蛋白具有NWYCY基序,属于NABD_Rossmann超家族,相对分子量为35.80 kD;预测SmCCR-2为中性亲水的稳定蛋白,存在跨膜结构域。实时荧光定量PCR结果表明,SmCCR-2基因在丹参各组织都有表达,茎中表达量最高。其表达受到病原菌的影响,表明SmCCR-2基因可能与植物防御反应有关。