丹参异戊烯焦磷酸异构酶基因(SmIPI)的生物信息学及表达分析

编号 zgly0000769857

文献类型 期刊论文

文献题名 丹参异戊烯焦磷酸异构酶基因(SmIPI)的生物信息学及表达分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 杨滢  周露  化文平  王喆之  李翠芹 

作者单位 教育部药用资源与天然药物化学重点实验室 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2011,47(11)

页码 1086-1090

年份 2011 

分类号 Q811.4 

关键词 丹参  异戊烯焦磷酸异构酶  生物信息学分析  实时荧光定量PCR  表达模式 

文摘内容 异戊烯焦磷酸异构酶(IPI)是萜类合成途径的关键酶之一。本文在丹参转录组高通量数据分析的基础上, 对丹参IPI基因(SmIPI)进行了克隆及序列分析。SmIPI脸长1234bp, 包含681bp的开放读码框, 编码226个氨基酸。生物信息学结构分析表明, SmIPI亲水性α/β蛋白, 包含有IPI结构域, 在序列组成、结构及活性位点等方面与其他植物的IPI均具有高度的相似性。实时荧光定量PCR分析结果表明, SmIPI在丹参生长的各个时期和不同组织器官中差异表达, 其表达受病原菌和茉莉酸甲酯的诱导。