毛竹GRF转录因子的生物信息学及表达分析

编号 zgly0001679035

文献类型 期刊论文

文献题名 毛竹GRF转录因子的生物信息学及表达分析

作者 魏宁  修文雯  孔祥超 

作者单位 山东省曲阜市林业局  山东省鱼台县滨湖中学 

母体文献 林业建设 

年卷期 2019年04期

年份 2019 

分类号 S795.7 

关键词 毛竹  GRF  转录因子  生物信息学 

文摘内容 通过生物信息学手段,对毛竹GRF(Growth-regulating factors, GRFs)转录因子基因家族成员展开研究。主要包括对毛竹转录因子家族成员的鉴定,基本信息的分析,进化分析,基因结构分析,保守基序分析,保守结构域分析,以及在不同组织中的表达分析。一共鉴定了18条毛竹GRF转录因子。根据拟南芥、水稻的系统进化树分析,将毛竹GRF转录因子划分为6个家族。利用Gene structure、NCBI和MEME在线分析软件,发现毛竹GRF转录因子的基因结构和氨基酸序列较为保守。表达量分析发现GRF转录因子普遍在花中表达丰度最高,其次在竹笋侧芽中表达丰度较高,而在叶片中表达量较低,表明GRF转录因子在毛竹花发育以及笋尖生长发育过程中发挥着重要的作用。