毛竹GRF转录因子家族的全基因组鉴定与分析

编号 zgly0001648672

文献类型 期刊论文

文献题名 毛竹GRF转录因子家族的全基因组鉴定与分析

作者 何龙燕  刘武阳  娄永峰  肖复明 

作者单位 江西农业大学江西省森林培育重点实验室  江西省林业科学院江西省植物生物技术重点实验室  江西省信丰县林木良种场 

母体文献 植物科学学报 

年卷期 2018年05期

年份 2018 

分类号 Q943.2  S795.7 

关键词 毛竹  GRF  基因家族  表达分析 

文摘内容 利用生物信息学方法,于毛竹(Phyllostachys edulis (Carr.) Lehaie)全基因组中鉴定获得18个GRF转录因子,并对其理化特性、保守结构域、系统发育关系、mi R396靶位点以及基因表达模式进行了分析。结果表明,18个Pe GRF蛋白长度为170～551 aa,分子量为18.5～58.8 k D;这些Pe GRF蛋白均具有QLQ和WRC结构域,部分Pe GRF含有FFD和TQL保守结构域。对毛竹、拟南芥(Arabidopsis thaliana (L.) Heynh)和水稻(Oryza sativa L.)的系统进化分析结果显示,毛竹18个GRF可分为3个亚类,且单子叶植物毛竹和水稻的GRF转录因子亲缘关系更近。mi R396靶位点预测分析结果发现,在13个Pe GRF基因序列的编码区存在毛竹mi R396结合位点; Pe GRF基因表达模式分析结果显示,Pe GRF主要在毛竹的竹笋中表达。