石榴SUT基因家族鉴定及其在籽粒发育过程中的表达分析

编号 zgly0001700040

文献类型 期刊论文

文献题名 石榴SUT基因家族鉴定及其在籽粒发育过程中的表达分析

作者 骆翔  曹尚银  李好先  赵弟广  张富红  陈丽娜  KrishnaPoudel  敬丹  唐丽颖 

作者单位 中国农业科学院郑州果树研究所 

母体文献 果树学报 

年卷期 2020年04期

年份 2020 

分类号 S665.4 

关键词 石榴  SUT  基因家族  籽粒  表达分析 

文摘内容 【目的】对石榴SUT家族基因成员进行全基因组鉴定,并分析SUT家族基因成员的结构域特征、启动子序列、生化特征、进化关系和表达特性,为深入研究该基因作用及其分子调控机制提供参考。【方法】利用同源比对及HMMER模型鉴定石榴SUT基因家族成员;利用邻近法和基因结构分析解析石榴SUT基因及其启动子序列的系统发生关系。【结果】共鉴定了10个石榴SUT基因,可以分为3大类;石榴SUT基因及其启动子区的GC含量都明显低于其在拟南芥和水稻中的含量;石榴SUT家族基因GC含量远高于启动子区的GC含量;石榴SUT基因的序列长度与GC含量呈明显正相关;石榴SUT基因启动子区含有10种MYB元件;此外,4个石榴SUT基因(PgL0328370.1、PgL0099690.1、PgL0145810.1和PgL0145770.1)在籽粒发育过程中发生了差异表达。【结论】SUT基因在进化过程中其序列和基因结构相对保守,而其启动子序列在进化过程中变化较大,SUT基因的表达量变化与籽粒发育显著相关。