基于基因组鉴定小桐子Dof转录因子家族及其表达分析

编号 zgly0001577088

文献类型 期刊论文

文献题名 基于基因组鉴定小桐子Dof转录因子家族及其表达分析

作者 王海波  唐利洲 

作者单位 曲靖师范学院云南高原生物资源保护与利用研究中心  曲靖师范学院云南省高校云贵高原动植物遗传多样性及生态适应性重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年03期

年份 2018 

分类号 Q943.2  S794.9 

关键词 小桐子  Dof  基因家族  转录因子  表达分析 

文摘内容 Dof蛋白是植物特有的C2-C2型锌指蛋白类转录因子,在植物碳氮代谢、次生物质合成、种子萌发及抗逆性等方面发挥重要作用。为全面解析小桐子Dof基因的特征,本研究基于小桐子基因组数据,对Dof基因家族进行了鉴定,并对其系统进化、基因结构、保守结构域及差异表达特性等进行了分析。结果表明,在小桐子基因组中共鉴定到24个Dof基因,GSDS基因结构分析显示都包含1(9个)或2(15个)个外显子,聚类分析结果将24个小桐子Dof蛋白分属于4个亚族及7个亚组,其中,有16个(66.7%)Dof蛋白的等电点偏碱性。荧光定量表达分析显示,JcDof1.4L与JcDof5.4L分别在茎与根中高表达,且两者都属于低温诱导表达基因,分别在低温胁迫3 h与24 h达到最大表达量,较对照分别提高4.06倍、8.96倍(p<0.01)。本研究结果为进一步开展小桐子Dof基因的克隆与功能鉴定提供了依据。