甜瓜Dof家族全基因组鉴定与表达分析

编号 zgly0001689411

文献类型 期刊论文

文献题名 甜瓜Dof家族全基因组鉴定与表达分析

作者 张焕欣  李国权  杨惠栋  曹娜  朱方红 

作者单位 江西省农业科学院园艺研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2019年11期

年份 2019 

分类号 S652 

关键词 甜瓜  Dof  基因家族  进化分析  表达特性 

文摘内容 基于甜瓜全基因组数据信息,利用生物信息学方法对甜瓜Dof家族基因进行了全面鉴定和系统发育分析,并通过Real-time PCR方法检测了CmDof家族成员对模拟干旱(PEG6000)、盐和低温胁迫的应答。结果表明:在甜瓜中存在34个Dof基因,除1、5和7号染色体外其余染色体均有分布,发生11次染色体片段重复事件和2次串联重复事件,外显子数在1～3之间,其蛋白质等电点在4.95～9.59之间;蛋白序列系统发育分析显示CmDof蛋白可分为9个进化亚群;组织表达模式分析发现该家族基因具有一定的时空表达特异性;多数CmDof基因对PEG6000、盐和低温胁迫有响应,其中CmDof3/CmDof5/CmDof10/CmDof17、CmDof3/CmDof5/CmDof10和CmDof3/CmDof5/CmDof32分别响应PEG6000、盐和低温胁迫。