中国野葡萄锌指蛋白基因的克隆及生物信息学分析

编号 zgly0001376422

文献类型 期刊论文

文献题名 中国野葡萄锌指蛋白基因的克隆及生物信息学分析

作者 文志丰  赵素平  王西平  王倩 

作者单位 西北农林科技大学园艺学院  农业部西北园艺植物种质资源应用重点开放实验室 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2010年10期

年份 2010 

分类号 S663.1 

关键词 中国野葡萄  白粉病  锌指蛋白  转录因子  RACE  生物信息学 

文摘内容 【目的】在受白粉病菌侵染的中国野葡萄叶片中克隆锌指蛋白基因全长,研究葡萄抗白粉病的分子机制。【方法】在前期采用mRNA差异显示技术获得的中国野葡萄华东葡萄株系白河35-1抗白粉病基因表达差异cDNA片段T11GG/B0324-292的基础上,利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆了该cDNA全长序列,并结合生物信息学方法对所获取的序列进行分析。【结果】该cDNA全长2663bp(GenBank登录号HM008621),具有完整的开放阅读框,基因全长2223bp,编码1个由740个氨基酸组成的锌指蛋白(Zinc finger protein),5′和3′非翻译区长度分别为395和44bp。多重比较分析表明,该基因推导的氨基酸序列与拟南芥、蒺藜苜蓿、水稻的C3H亚型CCCH型锌指蛋白的同源性分别为61%,70%和60%。【结论】利用RACE技术获得了锌指蛋白基因全长,为进一步研究锌指蛋白基因与葡萄抗白粉病的关系奠定了基础。