2个野扁桃自交不亲和S-RNase基因全长的克隆与序列分析

编号 zgly0001523656

文献类型 期刊论文

文献题名 2个野扁桃自交不亲和S-RNase基因全长的克隆与序列分析

作者 关鹏  曾斌  李疆  罗淑萍  王建友  李伟阳  田嘉  李鹏 

作者单位 新疆农业大学农学院  新疆农业大学林学与园艺学院·新疆农业大学果树学新疆特色果树研究中心  中国林业科学院新疆分院 

母体文献 果树学报 

年卷期 2016年08期

年份 2016 

分类号 S662.9 

关键词 野扁桃  自交不亲和性  S-RNase基因  生物信息学  RACE 

文摘内容 【目的】克隆新疆野扁桃(Amygdalus ledebouriana Schlecht.)自交不亲和性花柱特异性决定因子编码基因SRNase全长序列,为自交不亲和性的分子调控奠定基础。【方法】以新疆野扁桃花柱为试材,利用RT-PCR和RACE技术克隆S-RNase基因全长,采用BLAST和ORF Finder对核酸序列进行分析,利用CDD、Prot Param、Tmpred、Signal P、Target P、SOPMA、DANMAN、MEGA6和Prot Fun对推导的氨基酸序列进行分析。【结果】克隆到Pt S16-RNase基因和Pt S17-RNase基因,2者均属于RNase T2基因家族,与其他多种植物的S-RNase基因的序列相似度为83%~98%,序列均具有S-RNas蛋白典型结构。Pt S16-RNase基因ORF长690 bp,编码229个氨基酸,Pt S17-RNase基因ORF长678 bp,编码225个氨基酸。预测2个S-RNase蛋白均为亲水性、不稳定的分泌蛋白,二级结构均以α-螺旋、延伸链和无规卷曲为主,在蔷薇科李属植物中具有较高的系统进化一致性,可能的主要功能为水解酶和激素。【结论】获得2个新疆野扁桃自交不亲和性花柱特异性决定因子编码基因S-RNase全长序列。