毛竹AUX1/LAX候选基因家族鉴定与表达分析

编号 zgly0001738745

文献类型 期刊论文

文献题名 毛竹AUX1/LAX候选基因家族鉴定与表达分析

作者 杨乐  张康  李龙 

作者单位 西北农林科技大学林学院 

母体文献 西北林学院学报 

年卷期 2022,37(1)

页码 89-95

年份 2022 

分类号 S718.46 

关键词 AUX1/LAX  毛竹  基因表达  生物信息学 

文摘内容 AUX1/LAX家族是一类生长素输入载体,在植物生长发育和形态建成过程中起着重要的调控作用。利用同源比对的方法从毛竹基因组中鉴定出8个PheAUX1/LAX候选基因,进行系统进化树、基因结构、基序分析。结果表明,PheAUX1/LAX候选基因分为ClassⅠ和ClassⅡ2个亚组,其中classⅠ的候选基因包含6~7个外显子,而ClassⅡ的候选基因包含8~10个外显子。不同组织器官转录组数据分析表明多数ClassⅠ候选成员在毛竹冬笋中高丰度表达,而ClassⅡ中的PH02Gene38722.t在跳鞭中高丰度表达。通过qRT-PCR对AUX1/LAX候选基因在不同生长发育时期笋中的表达量分析表明,有6个候选基因与对照相比呈现出不同程度的上调表达,表明PheAUX1/LAX候选基因广泛参与毛竹笋的生长发育。本研究将为进一步研究毛竹AUX1/LAX基因的功能和调控机制奠定理论基础。