11条白桦BpSPL家族基因的生物信息学和表达分析

编号 zgly0001501803

文献类型 期刊论文

文献题名 11条白桦BpSPL家族基因的生物信息学和表达分析

作者 宁坤  杨洋  马述山  李慧玉 

作者单位 林木遗传育种国家重点实验室东北林业大学 

母体文献 林业科学研究 

年卷期 2016年05期

年份 2016 

分类号 S792.153 

关键词 白桦  BpSPL基因家族  生物信息学  基因表达 

文摘内容 [目的]研究白桦中SPL转录因子的基因序列特征及其在不同时期不同组织中的表达规律。[方法]依据白桦45个转录组测序结果,共获得12条全长SPL基因,依次命名为白桦BpSPL1-BpSPL12,对其中11条BpSPL进行了生物信息学及基因表达特征分析。[结果]生物信息学分析发现,11条BpSPL均含有1个高度保守的SBP结构域,且基因长度差异较大,含有2 10个不等数目的外显子,系统进化分析发现11条白桦SPL分属于六大类SPL蛋白;qRT-PCR分析结果显示,白桦BpSPL基因在不同时期的叶、顶芽、茎、雄花序中表达变化显著,多数SPL基因在顶芽中7月5日和8月20日至9月20日时期表达较高,除BpSPL1基因外在雄花序从6月份到9月份的生长阶段中,SPL的表达水平呈现逐渐升高的总体趋势。[结论]BpSPL基因可能参与到了白桦顶芽和雄花序的生长发育过程。