白桦BpLHY、BpTOC1与BpGI节律基因生物信息学及表达分析

编号 zgly0001501802

文献类型 期刊论文

文献题名 白桦BpLHY、BpTOC1与BpGI节律基因生物信息学及表达分析

作者 孙丰坤  周姗  李蕾蕾  詹亚光  曾凡锁 

作者单位 东北林业大学生命科学学院  林木遗传育种国家重点实验室 

母体文献 林业科学研究 

年卷期 2016年05期

年份 2016 

分类号 S792.153 

关键词 白桦  节律基因  生物信息学  非生物胁迫 

文摘内容 [目的]探究白桦生物钟基因运行机制及在生长发育、胁迫应答中的作用。[方法]运用生物信息学方法对白桦BpLHY、BpTOC1、BpGI节律基因进行分析,预测其编码蛋白的结构功能。利用RT-PCR方法检测白桦BpLHY、BpTOC1、BpGI基因昼夜表达模式,在非生物胁迫重金属Cd、低温(4℃)、与盐(Na Cl)及信号诱导SA(水杨酸)、SNP(硝普钠)下的表达情况。[结果]白桦BpLHY、BpTOC1、BpGI节律基因编码的均为疏水性非分泌型,具有跨膜能力的mixed蛋白。白桦BpTOC1、BpLHY基因表达量均呈现白天低夜晚高的昼夜变化模式,而BpGI表达量则表现出白天高夜晚低的模式。在重金属Cd、低温(4℃)、与盐(Na Cl)非生物胁迫下,BpLHY、BpTOC1与BpGI均上调表达。SA、SNP诱导白桦BpLHY与BpTOC1表达下调,而诱导BpGI表达上调。[结论]白桦BpLHY、BpTOC1、BpGI节律基因昼夜表达模式及非生物胁迫、信号诱导下的表达特征为进一步研究白桦生物钟基因作用机制及其在植物生长发育和胁迫应答中的作用奠定了基础。