白桦BpTCPs基因家族生物信息学及时空表达分析

编号 zgly0001636126

文献类型 期刊论文

文献题名 白桦BpTCPs基因家族生物信息学及时空表达分析

作者 董京祥  任丽  张园  杨洋  黄海娇  李慧玉 

作者单位 东北林业大学林学院 

母体文献 南京林业大学学报(自然科学版 

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 S792.153 

关键词 白桦  TCP基因家族  生物信息学  基因表达 

文摘内容 【目的】通过研究白桦TCP转录因子的序列特征及其在不同时期组织中的表达规律,为揭示BpTCPs在白桦生长发育中的作用提供证据。【方法】依据白桦45个转录组测序结果,共获得15条TCPs基因。利用生物信息学方法对TCPs基因进行了全面分析,采用实时荧光定量PCR技术分析基因在不同组织中的表达模式。【结果】生物信息学分析发现,15条BpTCPs均含有1个高度保守的b HLH结构域,系统进化分析发现15条白桦TCP分属于TCP蛋白的两大类;qRT-PCR分析结果显示,自5月到9月的生长阶段中,顶芽中BpTCPs的表达水平呈现不同程度升高的变化趋势;茎中BpTCP3在整个生长季上调表达;BpTCP4、BpTCP10及BpTCP7、BpTCP8分别在越冬后的雌花及雄花中上调表达。【结论】明确了BpTCPs基因的功能及揭示其参与调控植物生长的分子机制奠定基础。