白桦AP2/ERF家族基因的生物信息学分析

编号 zgly0001722089

文献类型 期刊论文

文献题名 白桦AP2/ERF家族基因的生物信息学分析

作者 张文慧  黄勇  贺登美  谷心茹  朱雪天  国凤双  卢有 

作者单位 黑龙江八一农垦大学农学院 

母体文献 西部林业科学 

年卷期 2020年06期

年份 2020 

分类号 S792.153 

关键词 AP2/ERF家族  生物信息学  转录因子  白桦 

文摘内容 从白桦转录组数据库中筛选出45条AP2/ERF家族蛋白,对其蛋白序列进行生物信息学分析和系统进化分析。结果表明,白桦AP2/ERF蛋白除了分为AP2、ERF、RAV和soloist家族外,还有2条蛋白不属于这些家族;不同组别白桦AP2/ERF蛋白在理化性质上存在差异;白桦AP2/ERF蛋白都含有磷酸化位点,但含有磷酸化位点的数量和种类上都有差异;白桦AP2/ERF蛋白大都定位在细胞核里,它们主要在细胞核中对下游基因进行转录调控;同一家族蛋白具有相同的三级结构及相同的motif,不同家族之间则存在差异。分析结果为白桦ERF基因功能研究提供参考。