毛竹IDD基因家族的生物信息学分析

编号 zgly0000850186

文献类型 期刊论文

文献题名 毛竹IDD基因家族的生物信息学分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 关鹰  许在恩  郭小勤 

作者单位 浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地 

母体文献 核农学报 

年卷期 2014(6)

页码 998-1005

年份 2014 

关键词 毛竹  IDD基因家族  转录因子  生物信息学 

文摘内容 IDD基因家族编码一种混合型的转录因子,本文通过本地Blast从毛竹(Phyllostachys heterocycla)基因组数据库获取到了9个IDD家族基因,并命名为PhID1和PhIDD1-8,其氨基酸序列均具IDDdomain结构特征,一个假定的核定位信号、2个C2H2和2个C2HC。氨基酸理化性质分析发现,PhIDD蛋白均为亲水性蛋白,含量较多是丙氨酸(Ala)、丝氨酸(Ser)和甘氨酸(Gly),全序列等电点分布在8.8~9.7之间,仅PhIDD2蛋白的等电点为5.6。除PhIDD2外,IDD-domain的等电点与全序列等电点基本一致。