羊口疮病毒QD/2015株B2L基因克隆及生物信息学分析

编号 zgly0001545665

文献类型 期刊论文

文献题名 羊口疮病毒QD/2015株B2L基因克隆及生物信息学分析

作者 李智  仲亮  张静  刘春羽  范俊豪  王海峰  牛云雷  张七斤 

作者单位 内蒙古农业大学兽医学院  巴林左旗动物疫病预防控制中心 

母体文献 中国动物检疫 

年卷期 2017年03期

年份 2017 

分类号 S852.65 

关键词 羊口疮病毒  B2L基因  生物信息学分析  蛋白结构预测 

文摘内容 为分析羊口疮病毒(ORFV/QD/2015株)B2L基因的分子特征,预测其编码蛋白的生物学功能,对其B2L基因进行PCR扩增、克隆及序列测定,应用生物信息学相关软件及方法,对扩增所得的基因进行序列分析,并对其编码蛋白的二级结构、细胞抗原表位、三级结构、跨膜结构域和信号肽等进行预测和分析。结果显示:ORFV/QD/2015株B2L基因序列长1 137 bp,编码379个氨基酸;该毒株与其他12株羊口疮病毒参考株的B2L基因核苷酸序列同源性为96.8%~99.7%,氨基酸序列同源性为96.8%~99.2%。系统进化分析显示,ORFV/QD/2015株与2015年分离到的ORFV/Shaan Xi/2015/China株亲缘关系最近;B2L基因编码蛋白二级结构以α-螺旋区域和β-折叠区域所占比例较大,预测此蛋白可能存在7个细胞优势抗原表位,无跨膜区域,无信号肽区域;三级结构呈弯曲状螺旋结构。