葡萄SNP标记的CAPS和TSP分析

编号 zgly0001445566

文献类型 期刊论文

文献题名 葡萄SNP标记的CAPS和TSP分析

作者 郭大龙  李猛  张国海  郭明晓 

作者单位 河南科技大学林学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2013年11期

年份 2013 

分类号 S663.1 

关键词 葡萄  单核苷酸多态性  酶切扩增多态性序列  温度转变PCR 

文摘内容 为了建立起葡萄SNP标记分析的一般方法和探索EST-SNP标记在葡萄中的应用,对前期开发的葡萄EST-SNP位点进行了筛选,设计了28对CAPS(cleaved amplified polymorphic sequences,酶切扩增多态性序列)标记引物和22对TSP(Temperature-switch PCR,温度转变PCR)标记引物,并在31份葡萄材料中进行了分析,其中20对CAPS引物和10对TSP引物电泳条带较清晰,多态性较好。基因分型统计显示:所有的SNP位点均含有2个等位基因,平均多态性信息含量(PIC)为0.336,平均Shannon’s信息指数为0.511。基因分型和葡萄材料聚类结果均显示这两种方法所获结果提供的信息量大且结果可靠。本方法简便、成本低,可作为SNP分型有效方法用于葡萄品种鉴定、基因分型和遗传多样性分析等。