毛白杨PtDREB2A基因的克隆、表达及单核苷酸多态性分析

编号 zgly0000650480

文献类型 期刊论文

文献题名 毛白杨PtDREB2A基因的克隆、表达及单核苷酸多态性分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 郭琦  王保垒  王博文  李百炼  张德强 

作者单位 北京林业大学林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室 

母体文献 林业科学 

年卷期 2011,47(4)

页码 49-56

年份 2011 

分类号 S718.46 Q943.2 

关键词 毛白杨  DREB2A基因  非生物胁迫  单核苷酸多态性 

文摘内容 利用基因特异的PCR引物由毛白杨受干旱胁迫后构建的cDNA文库中扩增获得一PtDREB2A cDNA克隆,并进行测序和序列分析,结果表明: PtDREB2A cDNA片段总长为946 bp,基因内部含有完整的开放阅读框架,大小为864 bp,可编码长度为287个氨基酸残基的蛋白质,所推导的蛋白质氨基酸序列在AP2/ERF结构功能域与拟南芥AtDREB2A和水稻OsDREB2A蛋白的同源性分别为80.3%和83.3%。组织特异性Realtime-PCR结果显示,PtDREB2A在杨树根、茎、叶片和顶端分生组织中均有表达,但其表达模式不同: PtDREB2A在叶片表达丰度最高,在树干皮层及根部组织表达丰度中等,而在顶端分生组织及主干韧皮部、形成层与木质部表达丰度最低。非生物胁迫及激素诱导差异表达显示,PtDREB2A不仅受高温、低温、干旱与盐诱导表达,还受到激素IAA,NAA及GA3的上调表达,但与ABA的诱导无关。组合利用MEGA4.0和DnaSP4.50.4软件对毛白杨45株基因型个体的PtDREB2A序列进行比对和分析,共检测到49个单核苷酸多态性(SNP)位点,SNP频率为1/18 bp,多样性指数π为0.010 48。在外显子区域,共检测到46个SNP位点,其中19个为同义突变,27个为错义突变。