毛白杨蔗糖合酶基因PtSUS1的克隆、表达及单核苷酸多态性分析

编号 zgly0000716523

文献类型 期刊论文

文献题名 毛白杨蔗糖合酶基因PtSUS1的克隆、表达及单核苷酸多态性分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 潘炜  田佳星  杜庆章  张志毅  张德强 

作者单位 北京林业大学林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室 

母体文献 林业科学 

年卷期 2011,47(3)

页码 52-58

年份 2011 

分类号 S718.46 Q943.2 

关键词 毛白杨  纤维素  蔗糖合酶  系统进化  单核苷酸多态性 

文摘内容 利用RT-PCR方法,首次从毛白杨成熟木质部cDNA文库中分离出PtSUS1 cDNA全长,并进行了测序和序列分析。结果表明: 克隆的毛白杨PtSUS1 cDNA片段总长为2703bp,基因内部含有完整的开放阅读框架,大小为2415bp,可编码长度为805个氨基酸残基的蛋白质,所推导的蛋白质氨基酸序列与拟南芥AtSUS1、水稻OsSUS1的蛋白质氨基酸序列同源性分别为83.4%,75.7%。组织特异性Realtime-PCR结果显示,PtSUS1在成熟木质部表达丰度最高,在成熟叶片、根部和正在发育的木质部表达丰度中等,在韧皮部和形成层有少量表达,在嫩叶与顶端分生组织中表达丰度最低。在此基础上,组合利用MEGA4.0和DnaSP4.50.4软件对毛白杨40株基因型个体的PtSUS1序列进行比对和分析,共检测到235个单核苷酸多态性(SNP)位点,SNP频率为1/25bp,多样性指数π为0.00924。在外显子区域,共检测到66个SNP位点,其中55个为同义突变,10个为错义突变,1个为无义突变。在编码区内,非同义突变与同义突变的比率〈1,这一结果显示在毛白杨物种演化过程中,纯化选择是PtSUS1基因内同义SNP位点主要的进化驱动力。