西洋梨全基因组bZIP基因家族生物信息学分析

编号 zgly0001728000

文献类型 期刊论文

文献题名 西洋梨全基因组bZIP基因家族生物信息学分析

作者 孙耀国  蔡天润  姬行舟  张军 

作者单位 河北农业大学林学院/河北省林木种质资源与森林保护重点实验室 

母体文献 林业与生态科学 

年卷期 2021,36(1)

页码 24-34

年份 2021 

分类号 S661.2 

关键词 西洋梨  bZIP转录因子  基因家族  生物信息学 

文摘内容 碱性亮氨酸拉链(Basic leucine zipper,bZIP),是广泛存在于真核生物中的保守转录因子,其在植物生长过程中参与重要的调控作用。为了解西洋梨bZIP基因家族相关信息,本研究利用生物信息学的方法,在全基因组水平鉴定并分析了西洋梨bZIP基因家族。结果表明,共鉴定出52个PcbZIP基因,系统进化将其分为9个亚族(A、B、C、E、F、G、H、I和S),PcbZIPs中外显子的个数从1~10个不等,PcbZIP转录因子的氨基酸数目在122~741个,等电点在5.42~10.41,PcbZIP基因都定位在细胞核上。基因定位显示,52个PcbZIP基因不均匀地分布在17条染色体上。本研究对西洋梨bZIP家族基因的鉴定与分析,为进一步开展西洋梨bZIP基因的挖掘与功能验证提供依据。