‘红阳’猕猴桃全基因组NBS-LRR类基因家族的生物信息学分析

编号 zgly0000934300

文献类型 期刊论文

文献题名 ‘红阳’猕猴桃全基因组NBS-LRR类基因家族的生物信息学分析

学科分类 220.35;野生动物保护与管理

作者 文欢  刘永立 

作者单位 浙江大学农业与生物技术学院 

母体文献 果树学报 

年卷期 2015(3)

页码 413-419

年份 2015 

关键词 猕猴桃  生物信息学  基因家族  NBS-LRR 

文摘内容 【目的】分析‘红阳’猕猴桃(Kiwifruit)中含有核苷酸结合位点(Nucleotide binding site,NBS)类基因。【方法】利用Kiwifruit Genome Database、Pfam和Coils Server网站,和Bioedit、MEGA 5.0、Clustal W软件,分析确定‘红阳’猕猴桃的NBS-LRR基因类型、结构和系统发育学关系。【结果】在‘红阳’猕猴桃全基因组中共有96个NBS-LRR类基因,其中27条NBS-LRR类基因分布在基因簇内,可根据其结构进一步划分为20类基因。