杜仲雄花芽2个发育时期转录组分析

编号 zgly0001706370

文献类型 期刊论文

文献题名 杜仲雄花芽2个发育时期转录组分析

作者 朱利利  杜庆鑫  何凤  庆军  杜红岩 

作者单位 中国林业科学研究院经济林研究开发中心  国家林业局杜仲工程技术研究中心 

母体文献 植物研究 

年卷期 2020年02期

年份 2020 

分类号 S567.19 

关键词 杜仲  雄花芽  不同发育时期  转录组测序  差异表达基因 

文摘内容 杜仲(Eucommia ulmoides)雄花富含多种活性成分和营养成分,具有重要的药用和营养价值。为了揭示杜仲雄蕊原基发育相关基因的表达情况,为杜仲雄花芽发育分子调控机制研究提供理论参考。本文以杜仲良种华仲11号(Huazhong No. 11)为材料,采用lllumina高通量测序技术,分别对苞叶原基分化期和雄蕊原基分化期的花芽进行转录组测序,通过生物信息学对2个发育时期的转录组进行比较分析,筛选出与雄花芽形态发育相关的差异基因。结果显示,转录组测序共获得40. 48 Gb过滤数据,各样品的clean reads与杜仲基因组进行序列比对,比对效率为90. 56%～93. 01%。在2个发育时期筛选出583个差异表达基因,其中在雄蕊原基发育期上调基因315个,下调基因267个。差异基因GO和KEGG功能分析显示,差异基因富集在与生长发育、光周期途径、激素合成和信号传导、碳代谢等相关的生物过程和代谢通路。结果显示光周期途径是杜仲成花诱导的重要途径,同时雄花芽在形态分化过程中受碳水化合物、植物激素和其他代谢物质调控。此外,MADS-box家族成员FLC、SOC1、AGL3和AGL8参与杜仲雄蕊器官发育。本研究为杜仲花发育基因调控提供了基础数据,也为雄花用杜仲的分子育种提供了参考。